Инфекции УПФ, зеленый стул, газы

Здравствуйте, уважаемый врач!
У меня сын, на данный момент ему 2,5 месяца.
Мы с рождения (10.12.16г) были на смешанном вскармливании, молока не хватало. Смесь фрисолак голд обычная. Я соблюдала диету, еда все паренное/варенное, но ела молочку: чай со сгущёнкой и молоком, много творога, кефир. Никто меня не научил и не подсказал, что молочку есть не желательно в первые 3-4 месяца. Ребёнок истошно кричал, спал меньше 10 часов в сутки, напрягал живот и бесконечно тужился, и 10 минут не могло пройти без потугов и напряжения животика. Все врачи говорили, что это колики, терпите до 3 мес. Также у ребёнка наблюдалась затяжная желтушка: анализ крови из вены от 31.01.17г - билирубин общий 92,5; билирубин прямой 8,2; билирубин непрямой 84,3. Врачи сказали, что для 1,5-2месячного ребёнка это норма. АЛТ при этом была в норме.
Мы скупили всевозможные препараты от коликов (эспусизан, саб симплекс, бэби калм, бебинос, плантекс, укропная вода). Ситуация не улучшалась. Стул у ребёнка был в пределах нормы (желтого цвета, жидковатый с комочками белыми). Назначили на всякий случай лактазу бэби, пропили 8 дней и отменили, потому как улучшений не наблюдалось. Грудного молока стало ещё меньше к 1,5 месяцам. Приняли решение перейти полностью на искусственное вскармливание, потому как подозревали, что живот так болит ещё и от смешанного вскармливания, т. к. плотность молока и смеси разная. Смесь стали кушать гипоаллергенную Фрисолак ГА. Стало немного лучше, но обильные газы и потуги не давали покоя. С 25 января по 10 февраля ребёнок сам не какал, т. к. по совету педиатра мы использовали газоотводную трубочку, вставляли ее на 10-15 см (также по совету врача нелепо дога). Поэтому кал выходил, когда применяли трубку. В кале стали появляться зеленые примеси. Врач назначила в качестве профилактики зостерин 1/3 пакета в день 10 дней, затем бифиформ. После курса зостерина кал стал темно-зеленого цветая. Я сдала анализ на дисбактериоз, результат: дисбиоз 3 степени (увеличение условно - патогенных энтеробактерий, представленное Klebsiella oxytoca, Enterobacter asburiae в количестве 10 ^ 6 КО, также стафилококк гемолитические и коагулазопозитивные в количестве 10 ^ 6 КО). Мы обратились в СПБ НИИДИ (детская инфекционка). Ребёнок был осмотрен, сказали кожа хорошая, эластичная. Единственное покраснение на щёчках нас беспокоят. Нам назначили лечение примерно на 2,5 мес: смесь Нутрилон пепти ГАСТРО, аципол, КИП, баксет бэби, пробифор, примадофилус. Также назначили сдать копрограмму кала, узнать pH кала и общий анализ мочи. Результаты перечисленных анализов прикреплены. Перешли на смесь Нутрилон гастро, кал зелёный до сих пор, иногда слизью, иногда жидковатый, с комочками белями. На данный момент нет возможности попасть на консультацию в НИИДИ.
Прошу Вас, проконсультируйте меня, пожалуйста. Важно Ваше мнение, насколько правильно назначено лечение?
Могли бы Вы прокомментировать свежие результаты анализов (кала и мочи).
Что могло вызвать такой дисбиоз 3 степени?
Повлияло ли нарушение диеты матери (когда я ела молочку и кормила грудью) на работу животика ребёнка?
Покраснения на щеках (фото приложила) это может быть аллергия? Кожа сухая, шелушится. Краснота в течение дня пропадает, и вновь появляется.

Буду безмерно благодарна Вам за консультацию. Спасибо!